五亭桥创建于乾隆丁丑年（1757年），《扬州画舫录》卷十三中有记载：“莲花桥在莲花埂，跨保障湖……上置五亭，下列四翼洞，正侧凡十有五，月满时每洞各衔一月，金色荡漾。乾隆丁丑，高御史创建”。至于建造莲花桥的目的，据画舫录载：“乾隆二十二年，高御史开莲花梗新河抵平山堂，两岸皆建名园。”

　　由此看来，莲花桥是为了开通至平山堂的水上御道，而连接南、北湖岸的交通而建。既是为接驾之用，造型又标新立异。古人就赞誉其精思巧艺“三五之夕，皓月当空，每洞各衔一月，计十五洞，金色荡漾。众月争辉。倒悬波心，不可捉摸，观此乃知西湖之三潭印月，不能专美于前。”其外型《扬州画舫录》卷十二和《乾隆南巡盛典名胜图录》图中都显示,当时桥上是五个单独的圆亭子，中央是重檐圆亭，四角为单檐圆亭，无廊连接。

　　1932年重建

　　特色：变圆亭为方亭 增加连廊

　　立碑为记

　　清咸丰五年（1856年），桥上的五亭毁于兵火。所以晚清时期画家笔下的莲花桥只有石桥空存。民国21年（1932年），《扬州览胜录》中记载：“于民国二十一年，邑人募资重建，计费九千七百余金，至二十二年落成。仪征陈延韡先生有重修碑记，建立桥之中心。”扬州很多老人均见过此块石碑。另外，有拓片记载了1932年——1933年莲花桥重修的情况。重建工程由邑人捐资，共收九千七百四十六元五角七分。胡筠、洪兰友、叶秀峰、王柏龄等社会名流均捐款资助，风景整理委员会也拨款四百四十七元八角二分，由建设局长李楹主持，通过招投标形式确定施工单位，镇江何元记营造厂承建，此次重修添购了黄瓦铜铃；相关资料也记载桥面为砖铺地，立柱直径只有20㎝左右，从民国31年出版的《老扬州》上的照片可以看出桥上五亭开始有连廊相接，外型基本与现状一致。但柱子过于纤细，整体来看，桥台厚重，亭柱纤巧，有上浮下重之感。

　　1942年重加修葺

　　特色：金碧丹青 备极华丽

　　民国壬午年（1942年），五亭桥再次进行修葺。据《扬州览胜录》中记载：“ 民国壬午年县长潘公宏器，重加修葺，复立石碑于桥上，金碧丹青，备极华丽，五亭四角，系以风铃，风来泠然有声，清响可听。”

　　1954年再行修建

　　特色：结构加固 黄瓦改换琉璃瓦

　　中华人民共和国成立后，由于桥基础下沉，石墙开裂导致木构架下沉，1954年由扬州建设科组织一次揭顶大修，采取桥箱出土,增加钢筋砼柱基，原木柱直径20CM，因木柱开裂严重，为了加固和保护，采取了木柱外围加钉板条再粉水泥的做法，柱间坐凳是拆原城区内牌坊对开剖用；至今还留下榫卯痕迹，黄瓦改用原皇帝行宫的黄琉璃瓦。

　　1984年再行维修

　　特色：加固基础，更换琉璃瓦

　　1984年扬州市园林管理处牵头，扬州市市政工程处施工，用砼整浇加固已下沉的基础，环氧树脂胶合石墙裂缝，同时更换黄色琉璃瓦，1954年移用的皇宫旧瓦，随着岁月流逝，破损越来越多，在宜兴建陶厂定制的琉璃瓦，原计划是与过去的琉璃瓦在色彩上一致的，但由于烧制时厂方配方的出入，结果颜色没有以前皇家建筑琉璃瓦的厚重，反而使莲花桥益显轻灵秀美。

　　1990年再行维修

　　缺憾：经费所限，维修未完成预定计划

　　1989年10月20日扬州市园林管理局按照市政府要求，主持对五亭桥查勘、测绘和修缮，由扬州市古典园林建设公司负责施工。但1990年维修时，因经费所限，实际未配石磉，立柱也没有更换，只是剥除水泥外粉部分及腐朽部分, 用墩接“拼柱法”将原柱0.20M作柱心，外拼柱法,拼成0.34M柱径。宝顶、花脊、戗脊、正当沟、斜当沟、兽、吻也没有定制，只是对残缺的水泥“寿”字脊进行了添补。1956年被列为江苏省文物保护单位，2006年被列为全国重点文物保护单位，是扬州人引以自豪的城标。